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(1)在思想建设方面，这些年来随着农村改革的深化，农民党员的思想观念有了很大变化，思想日益进步，但也有一些混乱。在这种情况下，如何把党员的思想进一步统一到邓小平理论和党的基本路线上来，做到既坚定党的基本信念，又适应新形势不断更新旧的陈腐观念，是一个非常艰巨的任务；在新形势下如何加强党员教育，改进和加强党的思想教育工作，使之真正收到实效，也是亟待解决的问题。
(2)在组织建设方面，核心问题是解决好选人用人问题。当前农村相当一部分基层组织领导班子整体功能不强，尤其缺少带领农民群众发展社会主义市场经济、加快奔小康步伐的本领。如何适应发展社会主义市场经济的需要，全面提高领导干部和各级干部的素质；随着二三产业的迅速发展，各种形式的新的经济组织大量出现，外出流动党员越来越多，基层党组织的设置和工作内容、工作方式亟待调整和改进，如何在新经济组织中建立党的组织，使党的组织设置、活动方式同发展变化的形势相适应；如何做好党员的发展工作，加强流动党员的管理，以更好地发挥党组织和党员的作用，特别是如何整顿一部分处于软弱涣散状态、瘫痪状态的基层组织的问题等，迫切需要研究解决。
(3)在政治建设上，确立正确的政治路线，保证正确的政治路线的贯彻执行，是党的政治建设的基本问题。党的新时期的“一个中心、两个基本点”的基本路线，是实践证明的正确路线，如何坚持一个中心和两个基本点的辩证统一，坚持党的基本路线一百年不动摇；如何坚持两手抓、两手都要硬，加强精神文明建设，促进社会全面进步，是党的建设的重大问题。
(4)在作风建设上，新形势下如何更好地坚持党的全心全意为人民服务的根本宗旨，保持党同人民群众的血肉联系，保持党的优良传统作风；如何有效地抵御消极腐败形象，防止和纠正以权谋私现象及行业不正之风，保证党的肌体健康等等。
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